Saturday, February 25, 2006

Sesión del 24 de febrero

CLASE
Experiencia de catedra:
Revisamos el concepto de inhibición. Distinguimos los tipos de inhibición como reversibles e irreversibles. Clasificamós a los inhibidores como competitivos, acompetitivos y no competitivos, revisamos sus expresiones cinéticas y la manera de indentificarlas a través del análisis de sus datos experimentales mediante las gráficas de Line-Weaberburk.

TALLER DE LECTURA
Siguen abiertos los dos foros de discusión a cerca de los artículos de TES y la proteólisis.

TALLER DE PROBLEMAS
Se resolvieron problemas de ajuste de parámétros cinéticos usando el modelo de Michaelis-Menten y las gráficas de Line-Weaberburk.
Se utilizó la herramienta de excel llamada solver para ajustar los datos experimentales y obtener parámetros cinéticos que ajustan mejor los datos experimentales.

CONTROLES DE LECTURA
Ya se encuentra disponible el control de lectura de el capítulo referente a el metabolismo de los carbohidratos

EXAMENES
El mini-examen de enzimas queda anulado y las preguntas conceptuales irán integradas al examen parcial del próximo 3 de marzo.

ASESORIAS:
A partir de esta fecha estará abierta la aula virtual de blackboard de 5:00 a 6:00 de lunes a viernes. (Es necesario concertar cita)

EXPOSICIONES
Proxima exposición 31 de marzo y 5 de abril. Es importante discutir el nivel de su exposición, En la exposición se deben integrar los conocimientos y habilidades desarrolladas en el curso.

CALENDARIO
1 de marzo: 1a Clase de metabolismo de carbohidratos y control de lectura No. 5
3 de marzo: Examen parcial I
8 de marzo: 2a Clase de metabolismo de carbohidratos
10 de marzo: 3a Clase de metabolismo de carbohidratos

Sesión del 22 de febrero

CLASE
Experiencia de catedra: Cofactores, coenzimas y grupos prostéticos.

Se explicó en clase que una diversidad de enzimas necesitan además de los residuos de aminoácidos en el sitio activo un ó varias moléculas no-proteícas para llevar acabo la catálisis. Dichas moléculas pueden ser metales ó compuestos orgánicos los cuales facilitan de manera general el ataque nuclofílico ó electrofílico del sustrato ó su facilitan su oxidación ó reducción. Mencionamos que los cofactores son iones metálicos y que las coenzimas son compuestos orgánicos que suelen unirse y disociarse dependiendo del mecanismo de la reacción catalizada. Los grupos prostéticos son compuestos orgánicos que se encuentran permanentemente en la enzima activa y que en muchos casos se encuentran unidos covalentemente a la enzima.

TALLER DE LECTURA
Se recordó que la evalución de esta actividad dependerá de su intervención en el foro de discución que se encuentra en Blackboard. Dicha intervención se evaluará dependiendo de su idoneidad, pertinencia y fundamento en los textos leidos ó en otros textos consultados. Los argumentos y las replicas tendrán puntos extras.

TALLER DE PROBLEMAS
Es necesario resolver los problemas de los capitulos anteriores y apuntar sus dudas para la proxima sesión de problemas.

CONTROLES DE LECTURA
Para recuperar controles de lectura es necesario pedir una clave e indicar cúando y cual control de lectura se desea recuperar. Nota importante: No se puede mejorar la calificación de un control de lectura que no se ha realizado.

MINI-EXAMEN
La calificación del miniexamen 4 ya se puede consultar

PROYECTO
Cada estudiante debe tener el siguiente avance de proyecto:
1 Enzima elegida
2 Secuencia de aminoacidos analizada (No. de a.a., regiones hidrófobicas)
3 Estructuras secundarias terciaria y/o cuaternaria
4 Reacción catalizada y ruta metabólica a la que pertenece

Saturday, February 18, 2006

Sesión del 17 de febrero

17/02/06
En la clase pasada hablamos de la importancia de los modelos cinéticos para entender el comportamiento de una enzima frente a uno de sus sustratos posibles. Establecimos que el Modelo cinético de Michaelis-Menten es una herramienta valida que explica satisfactoriamente el comportamiento de la mayoria de las enzimas conocidas. Nos dimos cuenta que el modelo de Michaelis-Menten corresponde matemáticamente a una hiperbola y encontramos que la ecuación reciproca es útil para definir los parámetros cinéticos a partir de los datos experimentales. La ecuación reciproca se conoce como la ecuación de Lineweaver-Burk.

En la próxima clase hablaremos de las distintas condiciones en que una enzima se inhibe y como podemos usar las graficas de Lineweaver-burk para determinar el tipo de inhibidor del que se trata.